• 四川大学华西医院医院感染管理部(成都  610041);
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医院感染暴发是患者安全的严重威胁,常常导致严重的后果。使用基因分型的方法明确暴发事件中的感染源和传播途径是控制感染暴发的重要因素。近年来,将病原体的全基因组测序(whole-genome sequencing,WGS)作为基因分型的工具,使得该项工作变得更加快速和精确。使用 WGS 技术能区分高度相关的病原体谱系,在确定暴发的同时追踪感染源信息,同时能提供更多的目标干预信息以及帮助理解传播动力学模型,避免了传统的同源性鉴别方法分型不精细、速度慢等缺陷。该文综述了 WGS 技术在医院感染暴发调查和控制中的应用实践,评价了其优势和面临的挑战。

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